一個挑戰(zhàn)學(xué)術(shù)權(quán)威廣告燈箱“指路牌”的樣本

作者:admin時間:2020-07-18

  中國科學(xué)家提出決定細菌大小的全新公式

  一個挑戰(zhàn)學(xué)術(shù)權(quán)威“指路牌”的樣本

  前不久,一則中國科學(xué)家挑戰(zhàn)兩大法則提出全新公式的消息,在微生物圈泛起波瀾,引發(fā)關(guān)注。

  這是中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院、深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院研究員劉陳立帶領(lǐng)科研團隊,歷時多年以大腸桿菌為模式生物,揭秘細菌大小的決定因素,推導(dǎo)出全新的個體生長分裂方程,修正了該領(lǐng)域原有的兩大生長法則。

  今年5月,這一成果的學(xué)術(shù)論文已由國際學(xué)術(shù)期刊《自然·微生物學(xué)》發(fā)表,其中提到,該成果給合成生物學(xué)領(lǐng)域生命體理性設(shè)計提供了建構(gòu)基礎(chǔ)原理。那么,這一成果究竟有多大意義,科研團隊在挑戰(zhàn)傳統(tǒng)法則的過程中又經(jīng)歷了什么,記者采訪了劉陳立團隊。

  傳統(tǒng)法則

  細菌,是自然界分布最廣、個體數(shù)量最多的單細胞生命體。從發(fā)酵酸奶的乳酸菌,到生產(chǎn)胰島素的大腸桿菌,可以說,閱報欄燈箱,細菌充斥于人類生活和科學(xué)研究的方方面面。

  當(dāng)然,如同人類肉眼可見的其他生物一樣,細菌也是有大有小的。

  劉陳立告訴記者,每種細菌有著各式各樣的可遺傳繼承的大小,這些微小細胞的體積有時可以相差百萬千萬倍:從0.3微米長的專性胞內(nèi)病源菌支原體,到600微米長的刺尾鯛腸道內(nèi)共生菌費氏刺骨魚菌,再到生長在納米比亞海邊肉眼可見的1毫米長的納米比亞嗜硫珠菌。

  當(dāng)然,較大的細菌是極少數(shù)的,大多數(shù)已知細菌的直徑在0.4-2微米之間,長度在0.5-5微米之間。劉陳立說,長期以來,細菌的大小,一直是細菌分類學(xué)中一個不可缺少的性狀,同時特定的大小使得細菌更能適應(yīng)其生存環(huán)境。

  過去100年來,生物學(xué)家一直想知道,究竟是什么決定了細胞的大小。在近代,雖然科學(xué)家知道了大部分控制細菌細胞周期和細胞分裂的分子,宣傳欄廠家,但人們?nèi)匀徊恢兰毦毎拇笮∈侨绾未_定的。

  上世紀50年代,美國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)“細菌細胞長得越快,細胞就越大”。更為重要的是,這一研究突破性地用一個數(shù)學(xué)公式,描述了細菌細胞生長速度和細胞大小之間的定量關(guān)系。

  簡單來說,只要知道細胞生長的快慢,就可以準確推斷出細胞的大小,反之亦然。這一公式后被稱為“SMK生長法則”。

  那么,細胞大小和生長速度之間,為什么會存在這樣的關(guān)系?

  1968年,另一位科學(xué)家在《自然》雜志上發(fā)表了他的觀點。這位科學(xué)家認為,細胞的大小,決定了細胞內(nèi)DNA何時開始新一輪復(fù)制。當(dāng)細胞進入復(fù)制階段時,細胞大小和復(fù)制起點數(shù)的比值是恒定不變的。

  后來,這一比值被學(xué)界稱為“起始質(zhì)量”。劉陳立說,由于細胞是指數(shù)生長,“起始質(zhì)量”及時間周期恒定,因此分裂時細胞的大小,和生長速率的指數(shù)次方成正比。

  這一觀點很好地契合了“SMK生長法則”,回答了“細菌大小是怎么決定的”這一基礎(chǔ)科學(xué)問題,被稱為“恒定起始質(zhì)量假說”。

  此后,這兩個統(tǒng)治了學(xué)術(shù)界半個世紀的生長法則環(huán)環(huán)相扣,就像科研道路上的“指路牌”一樣,閱報欄燈箱,在這一領(lǐng)域樹立權(quán)威60多年,多年來許許多多的研究,在兩大法則的指引下開展。

  一測三年

  當(dāng)然,在過去半個多世紀里,有一些研究團隊曾對這兩個法則的準確性提出質(zhì)疑,但由于缺乏系統(tǒng)全面的實驗數(shù)據(jù),相關(guān)結(jié)論并未引起領(lǐng)域內(nèi)大部分研究人員的重視。

  “要想修正主流細胞生長法則,必須要確保實驗數(shù)據(jù)完整的覆蓋度,以及高度的可重復(fù)性?!眲㈥惲⒄f。

  他帶領(lǐng)團隊潛心3年多研究,對兩大法則進行了系統(tǒng)性重復(fù)實驗。

  據(jù)此次成果論文的第一作者、中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院鄭海博士介紹,通常情況下,此類研究會選取1種或少數(shù)幾種培養(yǎng)基,而他們選擇了超過30種的培養(yǎng)基開展實驗。

  “我們采用早晚輪班制,對細胞的生長狀態(tài)進行實時監(jiān)控,以確保每次取樣都是在細胞穩(wěn)定狀態(tài)下進行?!编嵑8嬖V記者,在低生長速率條件下,完成一次實驗所需時間長達一周,而為確保數(shù)據(jù)可靠,實驗還需要重復(fù),重復(fù)次數(shù)多的超過9次。

  也因此,這次實驗成了迄今為止類似研究工作中,選用培養(yǎng)基種類最多、覆蓋生長速率范圍最廣的一次。

  鄭海說,帶著極大的耐心和嚴謹?shù)膽B(tài)度,科研團隊最終發(fā)現(xiàn),原有的兩大法則并不準確,被奉為經(jīng)典的“路牌”,可能將相關(guān)領(lǐng)域的研究引向了“偏離的方向”。

  “雖然生長速度越快,細胞越大,但二者之間的關(guān)系,并不符合SMK生長法則的預(yù)期?!眲㈥惲⒄f。